Three-dimensional visualization for phylogenetic tree

Research output: Contribution to journalArticle

2 Citations (Scopus)

Abstract

Филогенетические деревья используются для демонстрации эволюционной взаимосвязи между видами. Предыдущие исследования показали, что существует корреляция между мутациями и изменениями физико-химических свойств аминокислот. Рассмотрение физико-химических изменений белка дает дополнительные точки зрения на изучение процесса мутации. Система VirTree была разработана для визуализации ультраметрических филогенетических деревьев. Система создает трехмерное представление деревьев, а кроме того обеспечивает представление в среде виртуальной реальности. Система кластеризует объекты филогенетического дерева на основе физико-химических свойств аминокислоты, в то время как каждый лист имеет свою последовательность белка. Листья данного дерева также могут быть кластеризованы на основе структуры дерева и ветви, в которой они расположены. Добавление новой мерности дает возможность визуализировать каждый кластер индивидуально. Алгоритм кластеризации использует метрику на основе преобразования вейвлет-пакетов и метода классического многомерного шкалирования...
Original languageEnglish
Pages (from-to)59-66
Number of pages8
JournalScientific Visualization
Volume9
Issue number4
Publication statusPublished - 1 Jan 2017

Keywords

  • Physico-chemical property
  • Scientific visualization
  • Ultrametric phylogenetic tree
  • Viewlang
  • Virtual reality

ASJC Scopus subject areas

  • Software
  • Computer Vision and Pattern Recognition

GRNTI

  • 50.00.00 AUTOMATION. COMPUTER ENGINEERING

Level of Research Output

  • VAK List

Fingerprint Dive into the research topics of 'Three-dimensional visualization for phylogenetic tree'. Together they form a unique fingerprint.

  • Cite this