ГЕКСУРОНАТЫ ВЛИЯЮТ НА ОЛИГОМЕРНУЮ ФОРМУ СТРУКТУРНОГО БЕЛКА БАКТЕРИАЛЬНОГО НУКЛЕОИДА DPS И ЕГО СПОСОБНОСТЬ СВЯЗЫВАТЬСЯ С ЛИНЕЙНЫМИ ФРАГМЕНТАМИ ДНК

Татьяна Александровна Бессонова, С.А. Шумейко, Ю.А. Пуртов, С.С. Антипов, Е.В. Преображенская, М.Н. Туткина, О.Н. Озолинь

Результат исследований: Вклад в журналСтатья

Аннотация

Белки семейства Dps выполняют в бактериальных клетках две функции. Являясь ферритинами, они защищают клетки от токсичного действия Fe2+, а взаимодействуя c ДНК - конденсируют геном в отсутствие источников питания, при этом большое значение имеет способность Dps к самоагрегации. Механизм выxода генома из конденсированного состояния пока не известен. В работе исследовано влияние двух лигандов сахарной природы на взаимодействие Dps с ДНК in vitro. Впервые установлено, что D-глюкуронат и D-галактуронат, в отличие от D-глюкозы, способны разрушать додекамерную структуру белка. D-глюкуронат пpи этом стимулировал образование бинарных комплексов c линейными фрагментами ДНК. В результате гибкого молекулярного докинга было обнаружено, что молекулы всех трех углеводов потенциально могут образовывать кластер внутри белковой полости Dps, но D-глюкуронат и D-галактуронат связываются и в области межсубъединичных контактов олигомера. Обусловленная этим дестабилизация межсубъединичных связей может быть основным фактором, провоцирующим распад белка на более мелкие олигомерные формы. Закономерно снижая агрегацию, такое изменение структуры может играть ключевую роль в деконденсации генома при переходе клетки к фазе быстрого роста.
Переведенное названиеHexuronates Affect Oligomeric Form of a Structural Protein of Bacterial Nucleoid Dps and Its Aibility to Bind to Linear DNA Fragments
Язык оригиналаРусский
Страницы (с-по)1059-1067
Число страниц9
ЖурналБиофизика
Том61
Номер выпуска6
СостояниеОпубликовано - 2016

ГРНТИ

  • 34.00.00 БИОЛОГИЯ

Уровень публикации

  • Перечень ВАК

Fingerprint Подробные сведения о темах исследования «ГЕКСУРОНАТЫ ВЛИЯЮТ НА ОЛИГОМЕРНУЮ ФОРМУ СТРУКТУРНОГО БЕЛКА БАКТЕРИАЛЬНОГО НУКЛЕОИДА DPS И ЕГО СПОСОБНОСТЬ СВЯЗЫВАТЬСЯ С ЛИНЕЙНЫМИ ФРАГМЕНТАМИ ДНК». Вместе они формируют уникальный семантический отпечаток (fingerprint).

Цитировать